制药与化学工程学院成立于2007年（原为化工制药系），现设有制药工程、化学工程与工艺、药事管理、护理学、功能材料、新能源材料与器件6个本科专业，目前在校学生约1400人。学院紧密依托东南大学相关学科优势和办学积淀，立足于服务地方经济，坚持强化产教融合、校企合作、课程思政和科研育人，以应用型人才培养模式创新为核心、教学团队建设为根本、教学方式方法改革为手段、教学管理创新为保障，着力打造“化工、制药与材料，制药、药管与护理”交叉复合式高素质应用型本科人才。经过18年建设，形成了“需求导向、德育贯穿、产教融合、协同发展”的专业特色，实现专业内涵发展与产业升级相适应的专业建设目标。